04.07.2022

Gnuastro 0.17

Gnuastro — официальный пакет GNU, содержащий различные программы и библиотеки функций для манипуляции и анализа астрономических данных. Все программы предоставляют единый интерфейс командной строки, аналогичный GNU Coreutils.

Спасибо 4 мужчинам и 4 женщинам, непосредственно внёсшим вклад в исходные коды Gnuastro, а также 20 людям, подававшим идеи.

Нововведения

Новые программы

  • astscript-fits-view: скрипт, который принимает любое количество FITS-файлов, и открывает их визуализацию либо через SAO DS9 (для двумерных изображения и трёхмерных кубов), либо через TOPCAT (для таблиц). Для совместимых со стандартами freedesktop.org окружений также поставляется .desktop-файл, что позволяет открывать FITS-файлы просто по клику.
  • Набор скриптов для простой оценки и вычитания расширенных функций рассеяния точки (ФРТ) в очень модульном и легко масштабируемом виде. Основаны на методе, описанном Раулем Инфанте-Саинсом и др. в 2020 г.:
    • astscript-psf-select-stars: находит на изображении все звёзды, пригодные для построения расширенной ФРТ. Если изображение содержит WCS, скрипт также автоматически опрашивает Gaia для поиска подходящих звёзд;
    • astscript-psf-stamp: вырезает область заданной ширины вокруг определённой звезды из бо́льшего изображения, опционально с субпиксельной центровкой и маскировкой остальных источников света;
    • astscript-psf-scale-factor: по заданной модели ФРТ и координатам центра звезды на изображении рассчитывает коэффициент масштабирования, на который нужно умножить ФРТ для её масштабирования до этой звезды;
    • astscript-psf-unite: объединяет компоненты ФРТ в один. Из-за насыщения и нелинейности, для хорошей оценки расширенной ФРТ важно собирать части из разных диапазонов звёздных величин;
    • astscript-psf-subtract: по заданной модели ФРТ и координатам центра звезды на изображении, делает субпиксельное перепозиционирование ФРТ, масштабирует её до звезды и вычитает из изображения.

Книга

  • Новое руководство по выделению расширенной ФРТ из существующих научных данных, и по её вычитанию. Написано при участии Рауля Инфанте-Саинса и Сепиде́ Эскандарлу.
  • В 3-е руководство («Определение крупных расширенных целей») добавлен раздел «Коэффициент асимметрии в зависимости от сигнала, и его измерение».
  • В документацию по Arithmetic добавлен раздел «Преимущества и подводные камни целочисленных типов».

Все программы

  • Колонки, связанные с координатами, теперь во всех программах принимают не только градусы, но и шестидесятиричные значения. Так что, например, в программах Crop и Query опции --center=113.8729761,31.9027152 и --center=07h35m29.51,31d54m9.77 теперь эквивалентны. Также улучшены: опция --polygon у Table и Crop, опция --coord у Match и опция --crval у MakeProfiles.
  • Колонки FITS-таблиц теперь считываются параллельно, если значение --numthreads не выставлено в 1 и библиотека CFITSIO собрана с --enable-reentrant.

Arithmetic

Добавлены операторы:

  • add-dimension-fast: добавляет набор данных вдоль «быстрейшего» измерения первого набора данных (в FITS-изображениях, «быстрым» считается горизонтальное измерение). Например, если у вас есть N одномерных набор данных из M элементов, этот оператор позволяет построить двумерное FITS-изображение из N пикселей по горизонтали и M пикселей по вертикали;
  • repeat: кладёт копию указанного набора данных на стек операторов указанное количество раз.

Crop

  • --widthinpix: в WCS-режиме, значение --width будет интерпретировано в пикселях.

Fits

  • Если в HDU есть ключевое слово CHECKSUM, и вызваны любые ключевые слова модификации ключевых слов — Fits автоматически обновит ключевую сумму после всех изменений.

Table

  • Опции, принимающие строки (--colmetadata, --equal и --notequal), теперь принимают запятую внутри строки. Для отличения запятой от разделителя значений нужно предварять её символом \. Например, --equal=AB,cd\,ef выберет все строки, где колонка AB имеет значение cd,ef.
  • --catrowfile: файл, из которого нужно конкатенировать (добавить) строки в основную входную таблицу. Эту опцию можно использовать несколько раз, объединяя строки из любого количества таблиц в единую выходную таблицу. Эта операция выполняется после конкатенации колонок, но перед любыми операциями по выборке строк.
  • --catrowhdu: HDU FITS-файлов, переданных в --catrowfile.
  • --noblankend: убрать пустые строки из заданных колонок выходной таблицы, например, добавленных с помощью арифметики колонок или из других таблиц (это новое имя старой опции --noblank, новое её поведение описано ниже). Как и новую опцию --noblank, её можно вызывать много раз, таким образом, --noblankend=1 --noblankend=2 эквивалентно --noblankend=1,2.
  • Новый оператор для арифметики колонок — date-to-millisec: конвертирует форматированную строку даты в 64-разрядное число миллисекунд с начала эпохи Unix.

Match

  • Добавлен и включён по умолчанию поиск дубликатов с помощью KD-дерева. Для ещё большего ускорения можно сохранить дерево в файл.
  • --kdtree: задаёт использующийся алгоритм: internal (по умолчанию), build (постройка KD-дерева), FILE.fits (имя файла KD-дерева для импорта), или disable (включает старый алгоритм на основе сортировки).
  • --kdtreehdu: HDU внешнего файла KD-дерева.

Library

  • gal_fits_key_exists_fptr: проверяет, содержится ли заданное ключевое слово в уже открытом файловом дескрипторе FITS.

Удалённые возможности

Ничего в этом выпуске не удалено, не Gnome же.

Изменения

Arithmetic

  • add-dimension переименована в add-dimension-slow.

Segment

  • --onlyclumps переименована в --noobjects, из-за нежелательного предположения, что вывод будет содержать только HDU ‘CLUMPS’ — хотя как HDU в нём также присутствуют входное изображение (без уровня Sky) и изображение стандартного отклонения Sky. Для получения действительно чистого HDU ‘CLUMPS’ нужно также указывать опцию --rawoutput.

Match

  • По умолчанию (без опции --quiet) Match теперь выводит имена входов и временные метки важных шагов в stdout.

Table

  • Логика опции --noblank весьма подобна другим опциям выборки рядов по значению (например, --range, --polygon или --equal). Однако предыдущее поведение — применять её на последнем шаге Table, непосредственно перед выводом (то есть к выходной таблице, потенциально с изменённым набором и именами колонок), в отличие от прочих подобных опций, применяющихся ко входной таблице. Это неудобно и неинтуитивно, поэтому теперь она тоже применяется ко входной таблице, а также может применяться много раз. Опция со старым поведением переименована в --noblankend.
  • Оператор date-to-sec теперь возвращает только количество секунд, всегда знаковое и 64-разрядное — а не значение с плавающей точкой при наличии долей секунды во входном значении, как раньше.

Library

  • gal_fits_tab_read: теперь принимает количество потоков для чтения.
  • gal_table_read: аналогично (релевантно только для FITS-таблиц).
  • gal_blank_initialize: также работает со строчными данными — но инициализация только части крупного блока элементов поддерживается только для численных типов данных.

Исправлено 22 бага

>>> Скачать: LZip (подпись), GZip (подпись)

>>> Зависимости

>>> Список программ

>>> Руководство

>>> Подробности

Источник.